O Maranhão teve dois cursos incluídos na lista dos que terão vestibulares suspensos pelo Ministério da Educação (MEC). A medida foi tomada por conta da obtenção de índice insatisfatório (nota menor que 3) no Conceito Preliminar de Curso (CPC) nas últimas medições realizadas, em 2008 e 2011.
Os cursos com seletivos suspensos são: pedagogia (licenciatura) da FACIMP, em Imperatriz, e o curso de engenharia industrial mecânica, do Instituto Federal de Ciência e Tecnologia do Maranhão (IFMA).
As instituições a princípio perdem o direito de realizar novos processos seletivos para estes cursos em 2013, mesmo que cumpram as exigências estabelecidas pelo MEC. O que é considerada uma penalidade para os cursos que apresentaram tendência negativa, ou seja, já tinham tido desempenho ruim e não evoluíram em 2012.